Dans le cadre de leurs programmes d’intervention, les agences de l’eau aident financièrement, par le biais de subventions ou d’avances remboursables, les maîtres d’ouvrages publics (collectivités, syndicats de bassin…) ou privés (entreprises agricoles ou industrielles,…) qui réalisent des actions contribuant à la réduction de la pollution et à la protection de l’eau et des milieux aquatiques.
Ces actions peuvent relever d’études, de travaux de dépollution, d’améliorations d’infrastructures et de réseaux, de restauration des milieux aquatiques, de mesures de préventions et d’éducation, etc.
En 2012, la répartition prévue (il s'agit de budgets prévisionnels) des interventions des six agences pour le 10ème programme (2013-2018) était la suivante :
- 68% pour la lutte contre les pollutions dont 55,8% pour les pollutions domestiques, 5,7% pour les pollutions industrielles et 6,5% pour les pollutions agricoles ;
- 10,3% pour la gestion des milieux ;
- 8,4% pour l'eau potable ;
- 6,5% pour la gestion quantitative et l'adaptation au changement climatique ;
- 3,7% pour les études et connaissances ;
- 1,5% pour la planification ;
- 1% pour la coopération humanitaire ;
- 0,6% pour l'information du public et la sensibilisation.
Données : MEDDE , 2012
Source : 10ème programme des agences de l'eau 2013-2018, Dossier de presse, MEDDE , 2012